BioPerl と Ensembl API
仕事で、BioPerlとEnsembl APIを使う事になり、ちょっとしたバイオインフォマティシャン気分。楽しい、楽しい。とりあえず、BioPerlに慣れるために、資料を見ながら小さいスクリプトを作って遊ぶ。BioRuby Wikiの中のページが一番分かりやすくまとまっているのは、気のせいだろうか?(笑)
最終的な目的(というか顧客の要望)は、DNAマーカー情報の取得なんだけど、意外とそういう機能がないっぽい。dbSNPとかUniSTSあたりからデータを持ってくる方法って、誰か知りませんか?まぁ、探してみたところ無いっぽいんで、Ensemblから撮ってくる事になったわけですが・・・。
by fkmn
| 2006-04-17 23:53
| ライフサイエンス
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